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CRISPR新功能!开发智能凝胶材料,感应DNA改变特性。。。

  作者:代丝雨

  现在还有什么 CRISPR 不能做的吗?

  这是近期《自然》杂志上刊发的一篇评论里开头的一句话,也是我现在的心情。

  我们知道,CRISPR 是一种(超)好用的基因编辑工具,除了给基因序列修修补补、帮助治疗疾病,它还能追踪动物的发育过程,快速检测和诊断疾病,改良农作物,控制蚊子防疟疾……如今,CRISPR 又向一个新领域下手了。

  智能生物材料!


图源 pixabay

  这种新型的智能材料由水凝胶、单链 DNA 和 CRISPR-Cas12a 组成。当遇到目标 DNA 序列,Cas 酶就会切断材料内的 DNA,使凝胶的特性发生变化——比如说形状、硬度的变化,又或者是导电性、酸碱性的变化。

  那这个材料能干的事情就太多了~下可做载体靶向肿瘤 DNA 释放药物,上可联合其他平台做病原体检测,研究者还开发出了当“保险丝”的用法,可以说只有你想不到没有做不到~开发出这个大脑洞产品的是 MIT 的 James Collins 团队,论文发表在《科学》上[1]。


甚至可以用来包装细胞

  能够响应外部环境变化的材料并不罕见,我们上学的时候就应该从物理课本上了解过光敏开关的原理。除了光之外,声、温度、电磁场、PH 值都是已经广泛投入使用的可变材料响应元素。

  如果把应用限制在生物、医疗领域,那么很显然,这些响应元素就不是最优解了。对生物体来说,更敏感更具体的标志物是啥?大分子啊,蛋白啊,DNA 啊!

  DNA 是科学家们很关注的原材料。DNA 本身是高特异性的,能让材料的变化更有针对性;同时,DNA 也能够作为凝胶的一部分,与各种高聚物交联生成能够使用的材料

  让这种 DNA 交联材料产生变化,就得通过一些外部方法,比如说 DNA 置换,比如说酶促反应,总之都是一些很依靠“量”的手段。问题来了,想保证整个儿系统快速敏感,那第一靶向的 DNA 浓度不能太低,第二换个靶向序列整个儿系统恐怕都得重新设计。

  实用性 Emmmm……

  这个依赖 CRISPR 的材料智能之处就在这里了。

  这项研究中使用到的是 CRISPR-Cas12a。Cas12a 和我们最熟悉的 Cas9 有两点不同。一,Cas12a 对靶向序列的识别方法不一样,要更精准、错误率更低;二,Cas12a 在识别、切割所靶向的双链 DNA 之后,还会随机切割附近的单链 DNA


Cas12a 还会随机切割附近的单链 DNA

  用在这个智能材料里呢,当遇到靶 DNA,材料中的 Cas12a 就会开始工作把单链 DNA 切断,材料原本的特性就变化啦!

  CRISPR 可不是个严密的定量反应,它能切一个就能切一百个。根据研究者的测算数据,CRISPR-Cas12a 系统每秒的工作次数能够达到 1250 次。

  啥意思呢?只要外面有一丢丢靶 DNA 激活了 CRISPR-Cas12a 系统,它就能勤勤恳恳地开始工作了。这就相当于一个信号放大器,很少的 DNA 就能得到可检测的材料变化

  而且我们知道的,CRISPR 识别靶 DNA 主要靠一条向导 RNA,更换不同的向导 RNA,这套智能材料就可以用在任何我们想用的地方

  是不是简单方便好神奇!

  在论文中,研究者提出了四种可能的用法。

  第一种,做载体

  以聚乙二醇(PEG)为基质,遇靶 DNA 释放单链 DNA 交联的物质。

  第二种,做包装

  以聚丙烯酰胺(PA)为基质,遇靶 DNA 整个儿凝胶裂解,释放内容物。这里面能包裹的东西就多了,小分子药物、细胞因子等生物大分子甚至细胞都有可能。

  第三种,做电开关

  这种材料里面交联了导电炭黑(CB),通过切断单链 DNA 改变材料的导电性。这就是个感应 DNA 的保险丝啊。

  第四种,联合微流体设备快速检测病毒

  这种材料作为微流体设备种的填充物,随靶 DNA 改变渗透性,可以检测微量的病毒 DNA。在实际使用中,和其他基于 CRISPR 的检测技术灵敏度基本一样。


能检测到的病毒量相当低

  感觉这个智能材料的应用还远远不止这些呢。考虑好生物相容性和定量问题,拿来做生理指标体内监测不觉得也是个好主意吗?更换不同的 Cas 酶,识别更多的生物大分子,应用还可以更广~

  果然想象力才是第一科学生产力啊~你有啥脑洞,留言区分享下?

 

 

来自:
奇点网(ID:geekheal_com)

作者:Johnson
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